Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD247P20963 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD247P20963 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD247P20963 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD247P20963 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD247P20963 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms