Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIG1P18858 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIG1P18858 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LIG1P18858 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LIG1P18858 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LIG1P18858 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LIG1P18858 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LIG1P18858 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LIG1P18858 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LIG1P18858 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LIG1P18858 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms