Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms