Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD8BP10966 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD8BP10966 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms