Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHGAP10645 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHGAP10645 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHGAP10645 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHGAP10645 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHGAP10645 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms