Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GLI4P10075 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms