Protein–RNA interactions for Protein: P0CW23

AKAIN1, A-kinase anchor protein inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAIN1P0CW23 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AKAIN1P0CW23 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AKAIN1P0CW23 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms