Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB7P09629 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms