Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGF1P05230 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGF1P05230 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGF1P05230 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGF1P05230 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FGF1P05230 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms