Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms