Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC45O75419 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC45O75419 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC45O75419 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC45O75419 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms