Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms