Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms