Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCAO15360 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCAO15360 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCAO15360 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms