Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD9O15198 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD9O15198 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms