Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms