Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms