Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms