Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms