Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC169A6NNP5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms