Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PALM3A6NDB9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PALM3A6NDB9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms