Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms