Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms