Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms