Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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