Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9Y3F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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