Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms