Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms