Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms