Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms