Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIKQ9UKE5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms