Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO3Q9UK99 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms