Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms