Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms