Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms