Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRPC4Q9UBN4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRPC4Q9UBN4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms