Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD5Q9P267 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms