Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms