Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SH3BP4Q9P0V3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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