Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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