Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DNAH9Q9NYC9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms