Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms