Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDP1Q9NUW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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