Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP7BPQ9NSQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms