Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms