Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRT84Q9NSB2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms