Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLE3Q9NRF9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms