Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms