Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms