Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms